Audi heeft de pole position gepakt voor de 6 uur van Fuji. Lucas di Grassi en Loic Duval waren in hun Audi R18 e-tron quattro de Porsche-coureurs Brendon Hartley en Mark Webber in de Porsche 919 Hybrid net te snel af. De Toyota TS050 van Sebastian Buemi en Kazuki Nakajima klasseerde zich als derde LMP1. In de LMP2-klasse reden de teamgenoten van Giedo van der Garde, het debuterende drietal, naar de derde startpositie.
Op de Fuji Raceway was het geen gemakkelijke pole position voor Audi. Het tweetal Lucas di Grassi en Loic Duval reden in de Audi R18 e-tron quattro naar een gemiddelde rondetijd van 1.23,570. Voor de Audi met startnummer 8 was het de tweede pole position van het seizoen. De Audi-coureurs bleven slechts 0,025 voor op Brendon Hartley en Mark Webber in de Porsche 919 Hybrid. Met de Toyota TS050 van Sebastian Buemi en Kazuki Nakajima op slechts 0,169 seconde van de snelste Audi, toont aan hoe marginaal het gevecht tussen de drie merken waren.
Toyota legde overigens beslag op de volledige tweede startrij, want Stephane Sarrazin en Kamui Kobayashi zette de vierde tijd neer aan de voet van Mount Fuji, gevolgd door de tweede Audi. Voor de leiders in het wereldkampioenschap en winnaars van de 24 uur van Le Mans was het een teleurstellende kwalificatie, Neel Jani, Marc Lieb en Romain Domas vertrekken vanaf de zesde positie en zijn daarmee de laatste LMP1 van de autofabrikanten.
In de LMP2-klasse was G-Drive Racing op dreef en pakte met Roman Rusinov en Will Stevens de vijfde pole position van het seizoen. De G-Drive-coureurs reden naar een gemiddelde tijd van 1.31,698. Ook hier was het een mooi gevecht en bleek het verschil naar de Alpine A460 Nissan van Nicolas Lapierre en Gustavo Menezes klein. Het gat bedroeg slechts 0,221 seconden.
Giedo van der Garde kan tevreden terugkijken op de kwalificatie. De Nederlander kwam zelf niet in actie, maar zag zijn teamgenoten Antonio Giovinazzi en Sean Geleal met de rood/gele Extreme Speed Motorsport-bolide naar de derde tijd schieten. Een mooi debuut voor de drie coureurs en een goede uitgangspositie voor de wedstrijd op zondag.
Volledige uitslag van de kwalificatie voor de 6 uur van Fuji